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 本实验室原名为华南肿瘤学国家重点实验室，2005年通过专家论证和科技部批准建设，首任实验室主任是曾益新院士。自2005年以来，三次评估为良好类国家重点实验室。围绕服务“健康中国”国家战略目标，以国家重大任务和原始创新、关键技术为牵引，实验室名称优化重组为“华南恶性肿瘤防治全国重点实验室”。
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