本实验室原名为华南肿瘤学国家重点实验室，2005年通过专家论证和科技部批准建设，首任实验室主任是曾益新院士。自2005年以来，三次评估为良好类国家重点实验室。围绕服务“健康中国”国家战略目标，以国家重大任务和原始创新、关键技术为牵引，实验室名称优化重组为“华南恶性肿瘤防治全国重点实验室”。实验室以华南高发的鼻咽癌、肠癌和乳腺癌等为主要研究对象，利用粤港澳大湾区的区位优势，在病因预防、早期诊断、精准治疗新药创制和基础理论方面开展了系列研究，建立了大规模人群队列，已取得了一系列原始理论创新，临床诊治达到国际先进水平，对我国鼻咽癌和肠癌等肿瘤的防、诊、治做出了重要历史性贡献。

实验室建立以来，针对华南地区高发肿瘤——鼻咽癌的防、诊、治开展了全方位的研究。在国际上首次报道了亚洲人群鼻咽癌的遗传易感基因；鉴定了鼻咽癌诱发病毒EBV的高危亚型；为鼻咽癌的精准预防提供了决定性的依据。开展鼻咽癌筛查策略的研究，建立了高发区鼻咽癌筛查现场和30年、10万人的人群队列；推行基于EBV抗体检测的筛查策略，被卫健委纳入全国性筛查规范推广应用；开发了具有自主知识产权的鼻咽癌早筛试剂盒，为鼻咽癌的早诊提供了新策略和新工具；构建了鼻咽癌多层次的预后预测新体系；创新了人工智能的精准放射治疗模式；建立了中晚期鼻咽癌精准治疗的首选方案，成为全球鼻咽癌治疗的标准。实验室经过近20年的研究攻关，在筛查队列中将鼻咽癌的早诊率提高了近60%，后遗症发生率降低了24%，5年生存率提高了27%，在全球处于领跑地位。

实验室针对早期肠癌不易发现这一疑难问题，开发了高灵敏度的血检新技术，并创新性的将人工智能应用于肠癌的影像学诊断；创新了肠癌的二线治疗方案，在提升生活质量的同时，延长了晚期患者的平均生存期，成为国际临床实践新标准。实验室在乳腺癌微环境领域取得了开创性的基础研究成果，提出“肿瘤生态演进”新学说，为靶向肿瘤微环境及针对实体肿瘤的免疫治疗提供了新思路与新策略；开发了早期三阴乳腺癌的新疗法，在不提升治疗费用的同时，提高了患者5年生存率。

实验室建立了国际水平的抗肿瘤新药临床新药研究平台，开展了分子标志物指导下的临床研究，推动了10个国产原创新药上市（占全国27%），其中国产PD-1抗体——特瑞普利单抗降低了平均治疗费用16倍，惠及广大肿瘤患者。近20年来，实验室共开展了超过1000项注册类临床试验，优化了现有的临床治疗方案，提高了肿瘤患者的平均5年生存率，并大幅度提高了患者的生活质量。

本实验室2017年以来共承担国家重点研发计划、国家科技重大专项、国家自然科学基金创新研究群体等国家重大重点类项目共106项，资助总经费约5亿元。

实验室的学科地位、综合实力和国际影响力均为全国领先。

在学术影响力和学科建设方面。近5年，实验室在肿瘤基础、转化、前沿技术等方面取得的一系列原创性成果，论文发表在Nature（2篇）、Cell（4篇）、N Engl J Med、JAMA（3篇）、Lancet（2篇）、及BMJ等国际顶级期刊，16人入围Elsevier高被引学者榜单，在2021年全球科研机构自然指数榜中居全球癌症研究机构第四。实验室成员主编的医学研究生“国家级”规划教材《肿瘤学（第 5 版）》（人民卫生出版社）、《临床肿瘤学（第 5 版）》（科学出版社）为我国肿瘤学科研究生教学培养做出重要贡献。

在临床诊疗和转化应用方面。近5年，实验室在授权国际国内发明专利的基础上，成功转让项目16项（详见其他附件2：2017年以来专利成功转让项目）。56项研究成果被国际临床诊治指南引用，涵盖鼻咽癌、结直肠癌等多个癌肿，有效指导了国内外临床实践的改进（详见其他附件3：2017年以来临床研究成果被国际临床诊治指南引用情况）。2019年发布的NCCN指南引用中国大陆学者成果排名榜上，实验室位列国内医疗机构首位，在个人成果引用榜单上，前四名均来自本实验室。

在科研奖励方面。实验室获得国家级及其他重要成果奖励41项，其中：国家自然科学奖二等奖3项，国家科学技术进步奖二等奖4项。研究成果先后入选2018、2019年度“中国高等学校十大科技进展”、2019、2021年度“中国生命科学十大进展”、 2020年度“高等学校科学技术进步奖一等奖” 。

在国产高影响力学术期刊建设方面，实验室主办的SCI期刊Cancer Communications（IF 15.283）影响力稳步提升，是国内主办影响力最高的国际肿瘤学期刊，有效提升了我国在国际肿瘤学界的影响力和话语权。